Introductory Bioinformatics Workshop Anti-bacteria Resistance Genes Identification
&
The 6th CENMIG Anniversary Seminar
ขอเชิญร่วมงานอบรมเชิงปฏิบัติการทางชีวสารสนเทศระดับพื้นฐานเรื่อง การระบุยีนดื้อยาต้านแบคทีเรีย “Introductory Bioinformatics Workshop: Anti-bacterial Resistance Genes Identification”
หัวข้อในการฝึกอบรม:
- กลไกการดื้อยาต้านแบคทีเรียและการแพร่กระจายของยีนดื้อยาผ่าน Mobile Genetic Elements
- การตรวจวิเคราะห์ยีนดื้อยาในเชื้อวัณโรค (Anti-TB resistance)
- ฝึกปฏิบัติการใช้เครื่องมือและฐานข้อมูลชีวสารสนเทศระดับสากล ได้แก่ ResFinder, AMRFinderPlus, RGI, Abricate และ PlasmidFinder
- การแปลผลและการนำข้อมูลชีวสารสนเทศไปใช้ในงานวิจัยและการเฝ้าระวังทางระบาดวิทยา
วันที่: 19-20 พฤศจิกายน 2569
สถานที่: ห้องประชุมสตางค์ มงคลสุข คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล (พญาไท)
ค่าลงทะเบียน:
• นักศึกษา: 2,000 บาท (Early bird) / 3,000 บาท (ปกติ)
• บุคคลทั่วไป: 3,000 บาท (Early bird) / 4,000 บาท (ปกติ)
Early bird: ภายใน 22 ตุลาคม 2569
ปิดรับสมัครปกติ: 6 พฤศจิกายน 2569
สามารถลงทะเบียนได้ทางสแกน QR Code บนโปสเตอร์ หรือ เข้าผ่านลิงค์ https://forms.gle/YFsfSVaYnnLs1bMt6
ติดต่อสอบถามข้อมูลเพิ่มเติมได้ที่
อีเมล: cenmig.scmi@gmail.com
เบอร์โทรศัพท์: +662-201-5688 หรือ +66 87-358-4255 (K. วิโรจน์)
Instructional Team
Prasit Palittapongarnpim
CENMIG, Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University
Bangkok, Thailand
Brief Bio
Prof. Prasit Palittapongarnpim received his M.D. with First Class Honors from Mahidol University, a Certificate of Proficiency in Pediatrics from Chiang Mai University, Thailand, and postdoctoral training at the University of Alberta, Canada. He also earned B.Sc. degrees in both Medical Sciences and Mathematics. His main scientific interests are in the molecular biology and genomics of Mycobacterium tuberculosis as well as antimicrobial resistance (AMR). He founded and leads the Pornchai Matangkasombut Center for Microbial Genomics at Mahidol University. He has regularly published research on tuberculosis genomics and AMR and was recognized as a top 1% researcher at Mahidol University in both 2022 and 2023.
He has also worked on antituberculous drug discovery and has been involved in several networks related to emerging disease preparedness and research integrity. Dr. Prasit serves as an editorial board member and reviewer for several journals and funding agencies both in Thailand and internationally. He has also served multiple times as a temporary advisor to the World Health Organization (WHO). To date, he has published more than 120 papers, mostly on tuberculosis, and has held various administrative positions in Thailand. He currently serves as a university council member and a steering committee member for several institutes.
Bharkbhoom Jaemsai
CENMIG, Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University
Bangkok, Thailand
Brief Bio
Dr. Bharkbhoom Jaemsai is a researcher at CENMIG, Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University.
His primary research focuses on the genomics and evolutionary history of human pathogens, with a special emphasis on Mycobacterium tuberculosis. He is also exploring how bioinformatics can be applied to advance genomic research in fungal pathogens.
Nattapong Sanguankiattichai
CENMIG, Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University
Bangkok, Thailand
Brief Bio
Dr. Nattapong Sanguankiattichai is a lecturer at the Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University.
He earned his DPhil in Interdisciplinary Biosciences from the University of Oxford, where he studied a bacterial virulence factor and its evolution.
His research interests include the molecular mechanisms of host-pathogen interactions and the application of genomics to investigate pathogenic bacteria and antimicrobial resistance.
Tentative Schedule Thursday-Friday 19-20 November 2026
Introductory AMR Workshop Day 1 (19 November 2026)
| Topics | Instructors | |
|---|---|---|
| 09:00-09:10 | Opening Remarks | Prof.Prasit Palittapongarnpim |
| 09:10-09:40 | Lecture 1: The Problem of Antibacterial Compounds and Resistance | Prof.Prasit Palittapongarnpim |
| 09:40-10:40 | Lecture 2: Mechanism of Antibacterial Compounds and Resistance | Dr.Nattapong Sanguankiatichai |
| 10:40-11:00 | Coffee break | |
| 11:00-12:00 | Hands-on 1: Genome Assembly and Annotation Program | Dr.Bharkbhoom Jaemsai |
| 12:00-13:00 | Lunch | |
| 13:00-13:30 | Lecture 3: Software and Database for Identification of Drug-resistance Genes and Plasmids | Dr.Nattapong Sanguankiatichai |
| 13:30-15:00 | Hands-on 2: ResFinder, AMRFinderPlus, RGI, and Abricate | Dr.Nattapong Sanguankiatichai |
| 15:00-15:20 | Coffee break | |
| 15:20-16:00 | Lecture 4: Spread of AMR Genes and the Roles of Mobile Genetic Elements | Dr.Nattapong Sanguankiatichai |
| 16:00-17:00 | Hands-on 3: Plasmid Finder | Dr.Nattapong Sanguankiatichai |
Introductory AMR Workshop Day 2 (20 November 2026)
| Topics | Instructors | |
|---|---|---|
| 13:00-14:00 | Lecture 5: Anti-TB Resistanca | Prof.Prasit Palittapongarnpim |
| 14:00-15:00 | Hands-on 4: Anti-TB Resistance | Dr.Bharkbhoom Jaemsai |
| 15:00-15:20 | Coffee break | |
| 15:20-16:00 | Lecture 6: Interpretation of Bioinformatic Result | Prof.Prasit Palittapongarnpim |
| 16:00-17:00 | Discussion Session | Prof.Prasit Palittapongarnpim |
ขอเชิญร่วม การสัมมนาวิชาการเนื่องในโอกาสครบรอบ 6 ปี ศูนย์วิจัยจีโนมจุลินทรีย์
ศาสตราจารย์เกียรติคุณ พรชัย มาตังคสมบัติ “The 6th CENMIG Anniversary Seminar”
วิทยากรรับเชิญและหัวข้อในการสัมมนา:
- ศ. ดร.นพ. ดิเรก ลิ้มมธุรสกุล
Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, ThailandWinner of the 206 UNESCO-Carlo J. Finlay Prize for Microbiology Award
ในหัวข้อ “AMR Surveillance in LMICs: from Research to Policy Change, and The Prospects for Bioinformatics in Routine Setting” - Prof.Chew Chieng Yeo
Universiti Sultan Zainal Abidin, Malaysiaในหัวข้อ “The Common and The Rare: To Sequence or Not to Sequence?” - Prof.Shakeel Maolaboccus
Murdoch University, Australiaในหัวข้อ “Antimicrobial Resistance and Genomic Surveillance of MRSA and Enterococci Causing Bacteraemia in Australia” - รศ. ดร.ภากร เอี้ยวสกุล
CENMIG, Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University, Thailand
ในหัวข้อ “Phylogenetic Inconsistency of Pairwise SNP Clustering for Inferring TB Transmission in a High-Burden Setting: A Case Study from Thailand”
- ศ. ดร.นพ. ดิเรก ลิ้มมธุรสกุล
วันที่: 20 พฤศจิกายน 2569
สถานที่: ห้องประชุมสตางค์ มงคลสุข คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล (พญาไท)
ค่าลงทะเบียน: ฟรี ไม่มีค่าใช้จ่าย
ปิดรับลงทะเบียนปกติ: 13 พฤศจิกายน 2569
สามารถลงทะเบียนได้ทางสแกน QR Code บนโปสเตอร์ หรือ เข้าผ่านลิงค์ https://forms.gle/YaH337kCNMeFaNt3A
ติดต่อสอบถามข้อมูลเพิ่มเติมได้ที่
อีเมล: cenmig.scmi@gmail.com
เบอร์โทรศัพท์: +662-201-5688 หรือ +66 87-358-4255 (K. วิโรจน์)
Schedule for The 6th CENMIG Anniversary Seminar
Friday 20th November 2026
| Topics | Speakers | |
|---|---|---|
| 08:45-09:00 | Brief Report on CENMIG | Prof.Prasit Palittapongarnpim, CENMIG, Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University |
| 09:00-09:15 | Mahidol University Research Strategy and CENMIG | |
| 09:15-09:30 | Science Research Strategy and CENMIG | |
| 09:30-10:10 | Lecture 1: AMR Surveillance in LMICs: from Research to Policy Change, and The Prospects for Bioinformatics in Routine Setting | Prof. Direk Limmathurotsakul, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University. Winner of the 2026 UNESCO-Carlo J. Finlay Prize for Microbiology Award |
| 10:10-10:50 | Lecture 2: The Common and the Rare: To Sequence or Not to Sequence? | Prof. Chew Chieng Yeo, Universiti Sultan Zainal Abidin, Malaysia |
| 10:50-11:30 | Lecture 3: Antimicrobial Resistance and Genomic Surveillance of MRSA and Enterococci Causing Bacteraemia in Australia | Dr. Shakeel Maolaboccus, Murdoch University, Australia |
| 11:30-12:00 | Lecture 4: Phylogenetic Inconsistency of Pairwise SNP Clustering for Inferring TB Transmission in a High-Burden Setting: A Case Study from Thailand | Assoc Prof Pakorn Aiewsakun CENMIG, Department of Microbiology, Faculty of Science, Mahidol University |
Workshop and Seminar Location
Organized by
